Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ell2Q3UKU1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ell2Q3UKU1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms