Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Edc4Q3UJB9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Edc4Q3UJB9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Edc4Q3UJB9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms