Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW5

Rnf10, RING finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf10Q3UIW5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rnf10Q3UIW5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rnf10Q3UIW5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms