Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Puf60Q3UEB3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Puf60Q3UEB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms