Protein–RNA interactions for Protein: Q3UCV8

Otulin, Ubiquitin thioesterase otulin, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtulinQ3UCV8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
OtulinQ3UCV8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OtulinQ3UCV8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms