Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
YrdcQ3U5F4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms