Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rnf40Q3U319 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf40Q3U319 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rnf40Q3U319 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
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Rnf40Q3U319 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Rnf40Q3U319 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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Rnf40Q3U319 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Rnf40Q3U319 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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Rnf40Q3U319 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Rnf40Q3U319 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Rnf40Q3U319 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rnf40Q3U319 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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