Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccndbp1Q3TVC7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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