Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Fbxw18Q3TSA9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Fbxw18Q3TSA9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms