Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Usp39Q3TIX9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp39Q3TIX9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms