Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc13Q3TIR1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc13Q3TIR1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms