Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prr27Q3SYJ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prr27Q3SYJ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms