Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hdgfl1Q2VPR5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms