Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pi4k2aQ2TBE6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pi4k2aQ2TBE6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms