Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1aQ2LKU9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1aQ2LKU9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms