Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Samd11Q1RNF8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd11Q1RNF8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms