Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rpusd2Q149F1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd2Q149F1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd2Q149F1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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