Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Traf3ip1Q149C2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Traf3ip1Q149C2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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