Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc162pQ0VG85 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc162pQ0VG85 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms