Protein–RNA interactions for Protein: Q09324

Gcnt1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcnt1Q09324 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gcnt1Q09324 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gcnt1Q09324 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms