Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cass4Q08EC4 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cass4Q08EC4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms