Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q08AU9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q08AU9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q08AU9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q08AU9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q08AU9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q08AU9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.1 ms