Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnn1Q08091 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnn1Q08091 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms