Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Siah1bQ06985 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Siah1bQ06985 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms