Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dnal1Q05A62 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Dnal1Q05A62 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Dnal1Q05A62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms