Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Top1Q04750 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Top1Q04750 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms