Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Thbs2Q03350 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Thbs2Q03350 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms