Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nhlh1Q02576 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nhlh1Q02576 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms