Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Muc1Q02496 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Muc1Q02496 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms