Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mc1rQ01727 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mc1rQ01727 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms