Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax8Q00288 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pax8Q00288 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms