Protein–RNA interactions for Protein: Q00286

Pou1f1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou1f1Q00286 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pou1f1Q00286 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pou1f1Q00286 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms