Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gbp10Q000W5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gbp10Q000W5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms