Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AlkP97793 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AlkP97793 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AlkP97793 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
AlkP97793 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AlkP97793 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AlkP97793 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AlkP97793 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AlkP97793 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AlkP97793 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AlkP97793 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AlkP97793 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AlkP97793 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AlkP97793 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AlkP97793 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AlkP97793 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AlkP97793 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AlkP97793 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AlkP97793 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AlkP97793 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AlkP97793 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AlkP97793 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AlkP97793 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlkP97793 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlkP97793 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlkP97793 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
AlkP97793 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AlkP97793 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AlkP97793 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms