Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Cited1P97769 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cited1P97769 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms