Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gbx1P82976 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gbx1P82976 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms