Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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Irx1P81068 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx1P81068 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx1P81068 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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