Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Polr1bP70700 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Polr1bP70700 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms