Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gjb6P70689 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gjb6P70689 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms