Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp9xP70398 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp9xP70398 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp9xP70398 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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