Protein–RNA interactions for Protein: P70227

Itpr3, Inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itpr3P70227 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Itpr3P70227 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Itpr3P70227 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Itpr3P70227 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms