Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rps17P63276 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rps17P63276 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms