Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vamp2P63044 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp2P63044 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms