Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gnb1P62874 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gnb1P62874 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms