Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps13P62301 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps13P62301 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps13P62301 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps13P62301 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.6 ms