Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms