Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lmo4P61969 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lmo4P61969 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms