Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufm1P61961 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufm1P61961 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms