Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Depdc5P61460 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Depdc5P61460 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Depdc5P61460 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms