Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Siah1aP61092 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Siah1aP61092 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms